I musei non sono musei se non conservano una collezione di reperti da preservare e mostrare. Il Museo virtuale degli ecosistemi non ha una sua collezione, ma può mettere a disposizione le collezioni di musei di storia naturale, per renderle consultabili a tutti. Questa sezione del Museo virtuale contiene un archivio digitale di alcuni reperti che sono conservati in musei di storia naturale italiani. Da questa pagina si possono consultare le schede relative a questi reperti, che sono classificate seguendo i vocabolari e la struttura definiti per i beni naturalistici dall'Istituto Centrale per il Catalogo e la Documentazione (ICCD) del Ministero della Cultura.
Per eseguire la ricerca avanzata, si possono compilare tutti o alcuni dei campi sottostanti utilizzando gli strumenti della “logica Booleana” AND, OR o NOT come indicato nel menù a tendina sulla destra della riga di ricerca. Come “separatore” tra più parole si utilizza lo spazio tra caratteri.